MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 138229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020054	GAACT	2	10	47616	47625	40 %	20 %	20 %	20 %	436833436
1002	NC_020054	CAAC	2	8	47698	47705	50 %	0 %	0 %	50 %	436833436
1003	NC_020054	CG	3	6	47714	47719	0 %	0 %	50 %	50 %	436833436
1004	NC_020054	AAC	2	6	47883	47888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833436
1005	NC_020054	CAA	2	6	48191	48196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833436
1006	NC_020054	TGC	2	6	48208	48213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833436
1007	NC_020054	GACG	2	8	48254	48261	25 %	0 %	50 %	25 %	436833436
1008	NC_020054	TAC	2	6	48273	48278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833436
1009	NC_020054	GCA	2	6	48361	48366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833436
1010	NC_020054	TGC	2	6	48391	48396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833436
1011	NC_020054	TAC	2	6	48459	48464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833436
1012	NC_020054	CTC	2	6	48515	48520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833437
1013	NC_020054	TGTT	2	8	48546	48553	0 %	75 %	25 %	0 %	436833437
1014	NC_020054	CTG	2	6	48557	48562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833437
1015	NC_020054	CAG	2	6	48587	48592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833437
1016	NC_020054	CAG	2	6	48607	48612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833437
1017	NC_020054	CGG	3	9	48622	48630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833437
1018	NC_020054	TCT	2	6	48699	48704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833437
1019	NC_020054	ACC	2	6	48719	48724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833437
1020	NC_020054	ACA	2	6	48747	48752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833437
1021	NC_020054	CGG	2	6	48753	48758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833437
1022	NC_020054	CGC	2	6	48772	48777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833437
1023	NC_020054	CAA	2	6	48868	48873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833437
1024	NC_020054	CGT	2	6	48955	48960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833437
1025	NC_020054	CGC	2	6	48985	48990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833437
1026	NC_020054	TCAT	2	8	49025	49032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_020054	TTC	2	6	49087	49092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833438
1028	NC_020054	CGC	2	6	49202	49207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833438
1029	NC_020054	TCG	2	6	49219	49224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833438
1030	NC_020054	AATG	2	8	49345	49352	50 %	25 %	25 %	0 %	436833438
1031	NC_020054	GGTG	2	8	49484	49491	0 %	25 %	75 %	0 %	436833438
1032	NC_020054	GGC	2	6	49560	49565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833438
1033	NC_020054	AGC	2	6	49633	49638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833438
1034	NC_020054	GTG	2	6	49674	49679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833438
1035	NC_020054	TGTCGG	2	12	49741	49752	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436833438
1036	NC_020054	GCT	2	6	49796	49801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833438
1037	NC_020054	CAC	2	6	49838	49843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833438
1038	NC_020054	CCG	2	6	49881	49886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833438
1039	NC_020054	CAC	2	6	49910	49915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833438
1040	NC_020054	ACCG	2	8	49920	49927	25 %	0 %	25 %	50 %	436833438
1041	NC_020054	GTCAGC	2	12	50079	50090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436833438
1042	NC_020054	CGC	2	6	50128	50133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833438
1043	NC_020054	AC	3	6	50143	50148	50 %	0 %	0 %	50 %	436833438
1044	NC_020054	CGC	2	6	50279	50284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833438
1045	NC_020054	GTG	2	6	50310	50315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833438
1046	NC_020054	AAC	2	6	50317	50322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833438
1047	NC_020054	AGC	2	6	50382	50387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833438
1048	NC_020054	TTAAC	2	10	50508	50517	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1049	NC_020054	TCTA	2	8	50532	50539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_020054	TAT	2	6	50596	50601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436833439
1051	NC_020054	GATC	2	8	50662	50669	25 %	25 %	25 %	25 %	436833439
1052	NC_020054	CAG	2	6	50771	50776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1053	NC_020054	GCT	2	6	50779	50784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1054	NC_020054	CAT	2	6	50812	50817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833439
1055	NC_020054	GCCG	2	8	50878	50885	0 %	0 %	50 %	50 %	436833439
1056	NC_020054	TGG	2	6	50893	50898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833439
1057	NC_020054	CTG	2	6	50900	50905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1058	NC_020054	CAA	2	6	50917	50922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833439
1059	NC_020054	CGG	2	6	50928	50933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833439
1060	NC_020054	GGCA	2	8	50950	50957	25 %	0 %	50 %	25 %	436833439
1061	NC_020054	CA	3	6	50984	50989	50 %	0 %	0 %	50 %	436833439
1062	NC_020054	ACCG	2	8	51010	51017	25 %	0 %	25 %	50 %	436833439
1063	NC_020054	ATC	2	6	51050	51055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833439
1064	NC_020054	CTG	2	6	51089	51094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1065	NC_020054	CAT	2	6	51157	51162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833439
1066	NC_020054	CG	3	6	51199	51204	0 %	0 %	50 %	50 %	436833439
1067	NC_020054	CGAC	2	8	51243	51250	25 %	0 %	25 %	50 %	436833439
1068	NC_020054	GCG	2	6	51305	51310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833439
1069	NC_020054	ACG	2	6	51366	51371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1070	NC_020054	GGC	2	6	51437	51442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833439
1071	NC_020054	CTTT	2	8	51447	51454	0 %	75 %	0 %	25 %	436833439
1072	NC_020054	CTG	2	6	51473	51478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1073	NC_020054	GCCC	2	8	51535	51542	0 %	0 %	25 %	75 %	436833439
1074	NC_020054	GGT	2	6	51550	51555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833439
1075	NC_020054	GCC	2	6	51569	51574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833439
1076	NC_020054	GCC	2	6	51635	51640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833439
1077	NC_020054	ACA	2	6	51648	51653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833439
1078	NC_020054	GGC	2	6	51688	51693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833439
1079	NC_020054	CGA	2	6	51727	51732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1080	NC_020054	GTT	2	6	51733	51738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833439
1081	NC_020054	CGA	2	6	51877	51882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1082	NC_020054	CAA	2	6	51889	51894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833439
1083	NC_020054	CAG	2	6	51902	51907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1084	NC_020054	ACG	2	6	52004	52009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1085	NC_020054	CTGG	2	8	52036	52043	0 %	25 %	50 %	25 %	436833439
1086	NC_020054	AAC	2	6	52044	52049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833439
1087	NC_020054	CTG	2	6	52061	52066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833439
1088	NC_020054	CTG	2	6	52118	52123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1089	NC_020054	GGTA	2	8	52141	52148	25 %	25 %	50 %	0 %	436833440
1090	NC_020054	TAGA	2	8	52242	52249	50 %	25 %	25 %	0 %	436833440
1091	NC_020054	CGAT	2	8	52269	52276	25 %	25 %	25 %	25 %	436833440
1092	NC_020054	AAC	2	6	52350	52355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833440
1093	NC_020054	CCG	2	6	52426	52431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1094	NC_020054	CAG	2	6	52436	52441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1095	NC_020054	TCG	2	6	52453	52458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1096	NC_020054	AC	3	6	52465	52470	50 %	0 %	0 %	50 %	436833440
1097	NC_020054	CGG	2	6	52471	52476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1098	NC_020054	G	6	6	52475	52480	0 %	0 %	100 %	0 %	436833440
1099	NC_020054	CGGGTT	2	12	52549	52560	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436833440
1100	NC_020054	CCGG	2	8	52629	52636	0 %	0 %	50 %	50 %	436833440
1101	NC_020054	GGT	2	6	52658	52663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833440
1102	NC_020054	CGG	2	6	52672	52677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1103	NC_020054	CGC	2	6	52733	52738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1104	NC_020054	GTT	2	6	52758	52763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833440
1105	NC_020054	TGC	2	6	52764	52769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1106	NC_020054	CCG	2	6	52807	52812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1107	NC_020054	CGCC	2	8	52888	52895	0 %	0 %	25 %	75 %	436833440
1108	NC_020054	CGC	2	6	52975	52980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1109	NC_020054	CGT	2	6	53048	53053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1110	NC_020054	CTG	2	6	53082	53087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1111	NC_020054	AGC	2	6	53091	53096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1112	NC_020054	TCG	2	6	53139	53144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1113	NC_020054	ACC	2	6	53178	53183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833440
1114	NC_020054	CATA	2	8	53202	53209	50 %	25 %	0 %	25 %	436833440
1115	NC_020054	CGG	2	6	53224	53229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1116	NC_020054	CAC	2	6	53264	53269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833440
1117	NC_020054	GACT	2	8	53271	53278	25 %	25 %	25 %	25 %	436833440
1118	NC_020054	CAAC	2	8	53281	53288	50 %	0 %	0 %	50 %	436833440
1119	NC_020054	GCG	3	9	53323	53331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1120	NC_020054	CCCCG	2	10	53345	53354	0 %	0 %	20 %	80 %	436833440
1121	NC_020054	GCC	2	6	53486	53491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1122	NC_020054	CTGG	2	8	53534	53541	0 %	25 %	50 %	25 %	436833440
1123	NC_020054	GCG	2	6	53557	53562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1124	NC_020054	CAC	3	9	53594	53602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833440
1125	NC_020054	TGG	2	6	53626	53631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833440
1126	NC_020054	TGG	2	6	53689	53694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833440
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1130	NC_020054	CGC	2	6	53836	53841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
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1142	NC_020054	TTGG	2	8	54162	54169	0 %	50 %	50 %	0 %	436833440
1143	NC_020054	GCT	2	6	54194	54199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_020054	TGG	3	9	54209	54217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_020054	CCA	2	6	54237	54242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_020054	GCA	2	6	54276	54281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1147	NC_020054	AGT	2	6	54296	54301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_020054	CGT	2	6	54419	54424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833441
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1157	NC_020054	CGA	2	6	54857	54862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833442
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1191	NC_020054	TCAA	2	8	56477	56484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1212	NC_020054	TTC	2	6	57456	57461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1235	NC_020054	CGA	2	6	58716	58721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833445
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1243	NC_020054	A	6	6	59114	59119	100 %	0 %	0 %	0 %	436833446
1244	NC_020054	GGC	3	9	59194	59202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833446
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1248	NC_020054	CAG	3	9	59401	59409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833446
1249	NC_020054	CA	3	6	59419	59424	50 %	0 %	0 %	50 %	436833446
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1251	NC_020054	GTTC	2	8	59568	59575	0 %	50 %	25 %	25 %	436833446
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1378	NC_020054	TCG	2	6	65894	65899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833451
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1382	NC_020054	GTG	2	6	66143	66148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833451
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1385	NC_020054	TGG	2	6	66280	66285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833451
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1390	NC_020054	GGC	2	6	66719	66724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833452
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